Na Polinésia francesa testes atômicos foram feitos, em uma ilha isolada onde viviam repteis como: iguanas, Camaleões e etc...A explosão se fez e a radiação atingiu ovos de iguanas,
Logo tempos depois um navio japones é atacado por algo.Um unico homem sobreviveu foi um velho traumatizado que falava :"Gojira".Depois disso Nick Tatopoulos um cientista NRC
localizado na Zona de Exclusão de Chernobyl pesquisando os efeitos da radiação sobre a vida selvagem, é interrompida pela chegada de um agente do Estado E.U. Departamento. Ele é enviado para o Panamá, escoltado pelos militares, para observar os destroços do navio de pesca japonês e recuperou um par de pegadas enormes no solo gramado. O francês também está lá, observando a cena e se apresenta como um agente de seguros. A bordo de uma aeronave militar, Nick identifica amostras de pele, descobriu como pertencentes a um animal desconhecido. Ele descarta a teoria dos militares que a criatura é um dinossauro vivo, teorizando que as suas origens na Polinésia Francesa, torná-lo uma iguana mutante marinho criado por testes nucleares.Godzilla Viaja para Manhattan e destroi a cidade enteira criando um caos,A cidade é evacuada como a tentativa militar para destruí-lo. Com a ajuda de Nick, eles montaram uma armadilha para atrair os peixes Godzilla à tona. Ele pega a isca, mas é afugentado por fogo de armas pequenas e revida respiração fortes rajadas de vento combustíveis. Depois da batalha, Nick recolhe uma amostra de sangue. Com a ajuda de sua ex-namorada e repórter Audrey Timmonds, ele descobre que Godzilla reproduz de forma assexuada e está a recolher alimentos para sua prole.E logo resolvem procurar o ninho.O militar atrai Godzilla, mais uma vez, tentando prendê-lo em campo aberto do Central Park, mas não quando ele sprints fora. O monstro, em seguida, mergulha nas águas do Hudson, onde ele é atacado por três submarinos da Marinha E.U. nuclear. Godzilla é baleado e presume-se estar morto. Nick e equipe de Philippe Special Ops, sub-repticiamente seguido por Audrey e seu cameraman Animal Palotti ), faixa através dos túneis do metrô ao Madison Square Garden, onde o monstro tinha colocado centenas de 8-ft ovos de altura e fez o estádio inteiro um ninho . Enquanto as plantas os explosivos equipe, os ovos começam a eclodir, quase simultaneamente, e os dinossauros jovens como "bebês" começou a se alimentar de peixes que lhes resta. Quando o peixe tinha acabado, eles começam a caçar a equipe. Depois de não conseguir conter os bebês e perdendo vários membros da equipe, Nick, Philippe, Animal e Audrey se refugiar em uma cabine de transmissão de TV. Acreditando que os bebês acabará por forçar a humanidade à extinção, se escapar, Nick, Audrey e Animal alertar as autoridades, que forma uma greve imediata por um trio de F/A-18 Hornets. A fuga quatro, pouco antes do prédio seja destruído, e os bebês são queimados até a morte.Segundos depois, Godzilla, ainda vivo, emerge dos destroços e testemunhas do assassinato de sua ninhada inteira. Enfurecido, ele persegue os quatro seres humanos em torno de Manhattan, em um táxi. Eles conseguem alertar os militares, que os aconselhou a seduzir Godzilla para fora, ou seja, (aberto, a ponte de Brooklyn), onde ele torna-se irremediavelmente presa na suspensão cabos de aço e é um alvo fácil para os caças de retornar. Godzilla é, então, bateu impiedosamente pelos mísseis, quando então ele cai no chão e morre lentamente. A multidão e os militares comemoram morte de Godzilla. Como Nick, Audrey e Animal conciliar, Philippe calmamente as folhas, levando a fita de vídeo Animal tinha gravado. O filme termina em ruínas fumegantes de Madison Square Garden, e é revelado um único ovo que sobreviveu ao bombardeio. De repente, o ovo começa a rachar, e um bebê Godzilla escotilhas.
